VisionArray MYCO

VisionArray MYCO to:

• Jednoczesne genotypowanie najbardziej istotnych różnych gatunków Mycobacterium – produkty przeznaczone do diagnostyki in vitro
• Wszystkie sekwencje komplementarne i kontrole pozytywne są zlokalizowane na macierzy VisionArray jako duplikaty
• Wysoka czułość i specyficzność
• 1 próbka pacjenta = 1 szkiełko z macierzą
• Szybki i łatwy 1-godzinny protokół (od hybrydyzacji na szkiełku po komputerową analizę)
• Automatyczna ocena za pomocą oprogramowania VisionArray Analyzer – prosta wizualizacja i szybka analiza w zaledwie kilku minut

VisionArray MYCO to linia produktowa opracowana przez firmę 42 life sciences GmbH i dystrybuowana przez ZytoVision GmbH w serii VisionArray. Zasadniczym celem jej stosowania jest określenie genotypu bakterii z rodzaju  Mycobacterium w badanej próbce, która ma służyć w diagnostyce i doborze odpowiedniej strategii leczenia. Opisywana linia produktowa służy do potwierdzenia lub zaprzeczenia obecności Mycobacterium, Mycobacteroides, Mycolicibacillus, Mycolicibacter i Mycolicibacterium, a także kilka istotnych klinicznie gatunów mykobakterii, które zostały wyprodukowane przy pomocy VisionArray MYCO Primer Kit 1.0 lub VisionArray MYCO PreCise Master Mix (Rys. 1)

Rys. 1. Lista szczepów możliwa do zdiagnozowania metodą VisionArray MYCO oraz rozkład położenia na szklanej macierzy – VisionArray MYCO Chip 1.0.

Działanie systemu, podobnie jak produktów w serii VisionArray HPV, opiera się na kilku etapach:

Izolacja DNA z badanej próbki

Do przeprowadzenia tego etapu konieczny jest odpowiedni zestaw do ekstrakcji materiału genetycznego z badanej próbki. Izolację DNA można wykonać zestawami:

1. VisionArray FFPE DNA Extraction Kit (VI-0001-50) – zestaw przeznaczony dla próbek utrwalonych z formalinie i zatopionych w parafinie.
2. VisionArray Cytology DNA Extraction Kit (VI-0002-50) – zastaw przeznaczony dla próbek cytologicznych

Przeprowadzenie reakcji PCR

Poprzez reakcję PCR sekwencje DNA można amplifikować selektywnie. Podstawowa zasada testu opiera się na powtarzającym się okręgu 3 kroków: denaturacja, annealing i elongacja. Powtarzanie tych etapów prowadzi do wykładniczej amplifikacji sekwencji docelowych.

Pierwszym krokiem każdego cyklu jest denaturacja, gdzie ogrzewanie mieszaniny reakcyjnej prowadzi do  pojedynczych nici DNA. Podczas annealingu, komplementarne primery/startery łączą się z pojedynczymi nićmi DNA. Startery flankują sekwencję docelową i służą, jako punkt wyjściowy do integracji nukleotydów podczas fazy elongacji, tworząc identyczne kopie matrycowego DNA. Primery użyte w zestawie są wyznakowane cząsteczką biotyny. Dlatego każdy nowy produkt PCR jest automatycznie biotynylowany, co później umożliwia wykrycie przeciwciałem (Rys. 2).

Rys. 2. Reakcja PCR, jako jeden z etapów w teście VisionArray MYCO.

Do tego etapu konieczne są następujące produkty z serii VisionArray MYCO:

Hybrydyzacja produktów PCR z macierzą

Po selektywnej amplifikacji materiału genetycznego, biotynylowane sekwencje DNA należy zhybrydyzować z komplementarnymi nićmi DNA umieszczonymi na szklanej macierzy (Rys. 3).

Rys. 3. Hybrydyzacja produktów PCR z macierzą.

Aby z sukcesem przeprowadzić ten etap należy przygotować szklane macierze dostępne w dwóch wielkościach opakowań.

Wizualizacja

Po hybrydyzacji niespecyficznie związany DNA jest wypłukiwany przez krótkie i ostre etapy przemywania. Specyficznie związane biotynylowane sekwencje są następnie znakowane wtórnie za pomocą koniugatu streptawidyna-peroksydaza i wizualizowane przez barwienie tetrametylobenzydyną (TMB) (Rys. 4).

Rys. 4. Wizualizacja

Do przeprowadzenia tego etapu konieczne są:

Komputerowa analiza wyników.

W celu przeprowadzenia analizy wyników konieczny jest odpowiedni zestaw z oprogramowaniem do analizy wyników. W zależności od ilości przeprowadzanych testów dostępne są dwa rozwiązania na maksymalnie 2 lub 6 preparatów ocenianych podczas jednego skanowania. 

W celu uzyskania więcej szczegółów na temat produktów zachęcamy do zapoznania się dostępnymi materiałami i broszurami, jak również do kontaktu z naszym Działem Handlowym.