VisionArray ® MYCO Chip 1.0 - wyniki testu porównawczego TBC-PCR

Gruźlica (TBC) jest główną przyczyną śmierci wśród chorób zakaźnych z powodu pojedynczego czynnika, a także dziewiątą wiodąca przyczyną śmierci na świecie. W 2018 roku około 10 milionów ludzi zachorowało na TBC a 1.2 miliona zmarło w wyniku tej choroby. TBC jest spowodowane przez grupę prątków z rodziny Mycobacteriaceae (MTC) zawierającą 10 różnych gatunków Mycobacterium.

Szybka i jednoznaczna identyfikacja zakażeń prątkami ma kluczowe znaczenie dla kierowania zdrowiem publicznym i podejmowania decyzji ze względu na różnice gatunkowe w epidemiologii, zasięgu geograficznym, patogeniczności, i podatność na leki.

Podczas gdy badania mikroskopowe i hodowla są nadal niezbędne do diagnostyki laboratoryjnej TBC, zakres kilku molekularnych testów diagnostycznych ogromnie się rozszerzył. Testy te zapewniają wyniki przydatne dla wysokiej jakości opieki nad pacjentem.

QuIP, jako wspólne przedsięwzięcie Niemieckiego Towarzystwa Patologicznego oraz Federalnego Stowarzyszenia Niemieckich Patologów, oferuje cykliczne testy kontroli jakości stosowanych metod diagnostycznych. Badania te przeprowadzane są raz na dwa lata w kilku laboratoriach molekularnych dokonujących detekcji DNA Mycobacterium w tkankach utrwalonych w formalinie i zatopionych w parafinie (FFPE). Wyniki porównawcze pozwalają na formułowanie oświadczeń odnośnie diagnostyki, jej dokładności i jakości wyników.

Metoda oceny:

• Każde uczestniczące laboratorium otrzymuje dziesięć różnych próbek FFPE, które muszą zostać przeanalizowane metodą molekularną. Próbki te pochodzą z różnych części ciała (jądro, płuco, język, oko czy ściana aorty)

• Dla każdej próbki wyniki wskazują, czy DNA od członków kompleksu M. tuberculosis (MTC-DNA) jest obecny w materiale testowym (tak / nie). Należy je przesłać do QuIP w ciągu 10 dni od otrzymania próbek

• Po otrzymaniu raportów z badań zespół koordynujący ocenia wyniki dla każdej próbki i porównuje je z wynikami uzyskanymi przez laboratoria referencyjne

Wyniki:

35 laboratoriów wzięło udział w cyklicznym badaniu QuIP TBC-PCR w 2019 przy użyciu różnych metod molekularnych do wykrywania DNA z gatunków Mycobacterium, które mogą powodować gruźlicę. Obok ZytoVision wykorzystano systemy Chipron, Qiagen i inne. System VissionArray z powodzeniem zastosowano, jako metodę testową w 4 laboratoriach (w tym laboratorium ZytoVision).

31 laboratoriów (89%) zakończyło z sukcesem udział w programie uzyskując co najmniej 19 na 20 punktów.

Firma ZytoVision przy pomocy swojej metody (VissionArray) osiągnęła pełny wynik 20 punktów (na 20 możliwych).

Przegląd wyników wszystkich uczestniczących laboratoriów prezentuje poniższe zestawienie (na czerwono wynik uzyskany przez ZytoVision z VisionArray ® MYCO Chip 1.0 pośród innych metod):

Metody testowania uczestniczących laboratoriów oraz uzyskane za ich pomocą wyniki obrazuje poniższa grafika:

VissionArray – Metoda i opis

DNA jest ekstrahowany np. z próbki FFPE i służy, jako szablon do PCR.

Do amplifikacji stosuje się biotynowalne startery.

Po amplifikacji, biotynowalne sekwencje hybrydyzują z komplementarnymi sekwencjami DNA.

Specjalnie związane i biotynowalne sekwencje są wizualizowane przez wtórne znakowanie streptawidyną-peroksydazą.

VissionArray to:

• równoczesne genotypowanie odpowiednich, różnych gatunków Mycobacterium – certyfikat in vitro,

• wysoka czułość i swoistość,

• jedna próbka od jednego pacjenta – jeden preparat,

• szybki i łatwy 1-godzinnny protokół

• zautomatyzowana ocena za pomocą dedykowanego oprogramowania – prosta wizualizacja i szybka analiza w zaledwie kilka minut

Celem zapoznania się ze szczegółową procedurą oraz dostępnymi produktami zachęcamy do lektury załączonej ulotki.